É um épico de ação e aventura num Japão de fantasia, do aclamado estúdio de animação LAIKA. O inteligente e bondoso Kubo ganha a vida de forma humilde, contando histórias fantásticas às pessoas da sua cidade à beira-mar, incluindo Kameyo, Hosato e Akihiro. Mas a sua relativamente tranquila existência é destruída quando acidentalmente convoca um espírito mítico do seu passado que desce dos céus para cumprir uma antiga vingança.