Uma das componentes importantes associada ao Campus Aeronáutico de Ponte de Sor é a ligação às universidades e politécnicos. Nesse sentido a Câmara estabeleceu acordos de cooperação com vista à investigação e à implementação de cursos em vários domínios com seis instituições de ensino superior, a saber: ISEC; universidades da Beira Interior e de Évora, e institutos politécnicos de Portalegre, Setúbal e Castelo Branco.

Já este ano irá funcionar, em Ponte de Sor, um curso Técnico Superior Profissional em Produção Aeronáutica ministrado pelo Politécnico de Setúbal e cujas inscrições se encontram abertas. O Politécnico de Portalegre através do seu centro de línguas também tem ministrado diversas ações de formação. O acordo com o IPP é mais alargado e mereceu elogios por parte do presidente da instituição de ensino, Joaquim Mourato.

Também a reitora da Universidade de Évora mostrou otimismo aquando da assinatura do acordo. Segundo Ana Costa Freitas, "deste protocolo resultará a elaboração de um plano de intervenção no âmbito destas áreas, em que a Universidade de Évora entra sobretudo ao nível do desenvolvimento de ações de formação consideradas pertinentes, com vantagens claras para os dois outorgantes".

Já a UBI, que tem cursos em engenharia aeronáutica, estabeleceu um acordo que permitirá que alunos de Engenharia Aeronáutica, Eletromecânica e Eletrotécnica e Computadores realizem estágios naquele município através do aeródromo de Ponte de Sor.

Por sua vez com o IPCB poderão vir a realizar-se cursos Técnicos Superiores Profissionais (Tesp) em proteção civil e outras formações breves, como referiu o seu presidente, Carlos Maia, aquando da assinatura do acordo.