O curso de Mestrado (2º Ciclo) em Engenharia Eletromecânica da UBI foi acreditado por 5 anos pela Agência de Avaliação e Acreditação do Ensino Superior (A3ES). O relatório final da Comissão de Avaliação Externa refere que a instituição tem uma larga experiência na formação no âmbito da engenharia eletromecânica, estando o ciclo de estudos bem caracterizado nos seus objetivos. O curso, no seu formato atual, já tinha sido avaliado pela Ordem dos Engenheiros, em 2012, tendo sido distinguido com a marca de qualidade europeia EUR-ACE pelo prazo máximo de seis anos.